非本人机动车备案成功后，可以通过以下方式处理违章并扣分：
1. 登录交通安全综合服务管理平台（URL）或交管12123手机APP进行操作。
2. 在平台或APP中选择“非本人机动车”功能模块。
3. 输入需要处理违章的机动车信息，包括车牌号、发动机号后六位等。
4. 查看该车的违章记录，确认无误后选择处理违章。
5. 按照提示完成支付罚款的操作，违章处理完成后，相应的记分就会自动记在该备案人的驾驶证上。
需要注意的是，处理违章必须使用备案人的驾驶证，且一个驾驶证最多只能同时备案三台非本人机动车。另外，处理违章时需要确保驾驶证积分足够扣减违章的记分。