在大多数情况下，如果电动车与机动车发生碰撞，责任应该由电动车主承担。这是因为电动车属于非机动车，而机动车属于高速行驶的车辆，因此根据交通法规，非机动车应当遵守安全通行规定，避让正常行驶的机动车。
然而，这并不意味着机动车就没有任何责任。在某些特殊情况下，比如机动车违反了交通规则（如超速、未保持安全距离等），那么机动车也需要承担相应的责任。
至于机动车申请保险赔偿的问题，这需要看具体的保险条款和事故情况。一般来说，如果机动车购买了第三者责任险，那么在发生事故时，保险公司会根据保险合同进行相应的赔偿。但是，如果事故是由于电动车主的过错造成的，那么机动车的保险公司可能会对赔偿金额进行一定的扣除。