在深圳，以下是在当地申请港澳通行证的步骤：
1. 准备所需材料：身份证、户口本、照片（近期2寸白底彩照）以及填写好的《中国公民出入境证件申请表》。
2. 预约办理时间：前往深圳市出入境管理局官网进行预约，选择就近的出入境办证大厅，并按照预约时间前往办理。
3. 提交申请材料：在办证大厅完成材料提交，工作人员会核对你的信息并进行初步审核。
4. 采集指纹和拍照：根据工作人员的指引，完成指纹采集和个人证件照拍摄。
5. 缴纳费用：按照规定支付港澳通行证工本费和相关服务费。
6. 领取证件：在规定的时间内凭领取单到办证大厅领取港澳通行证。
注意：首次办理港澳通行证需要本人亲自前往办理，不能代办。