在南京，以下是为您的车辆申请营运证的步骤：
1. 准备相关材料。您需要提供以下材料：
- 车主身份证原件及复印件； - 车辆行驶证原件及复印件； - 车辆登记证书原件及复印件； - 驾驶员驾驶证原件及复印件； - 从业资格证（驾驶员）原件及复印件； - 车辆综合性能检测报告； - 环保合格证明； - 车辆购置税完税证明； - 营运合同或协议； - 其他需要的材料。
2. 到南京市运输管理处提交申请材料。地址是南京市建邺区江东中路259号。
3. 等待审核。相关部门会对您的申请进行审核，包括对车辆的检查、对驾驶员的审查等。
4. 缴纳相关费用。如果您的申请被批准，您需要按照规定支付营运证工本费等相关费用。
5. 领取营运证。审核通过后，您可以在规定的时间内前往南京市运输管理处领取营运证。
请注意，以上流程可能会因政策变动而有所调整，建议您在操作前先咨询当地相关部门以获取最准确的信息。