12123是公安部官方互联网交通安全综合服务管理控制平台的唯一网站，负责处理交通违章和缴纳罚款等事务。然而，关于补考费用需要交两次的问题，可能涉及到具体的地区或考试机构的规定和政策。
一般来说，补考费用只应交纳一次。如果遇到了需要交纳两次的情况，可能是以下原因：
1. 第一次交费时，款项没有成功支付到指定的账户或者没有正确填写相关信息导致退款。这种情况下，你需要重新支付补考费用。
2. 在某些地方，不同的科目可能需要分别缴费。例如，如果你需要在两个不同的时间参加不同的科目的补考，那么你可能需要为每个科目分别支付补考费用。
建议你向当地的交通管理部门或考试机构咨询具体细节，以确保你的问题得到妥善解决。