飞机改签手续费的扣除方式因航空公司和购票渠道而异。以下是一些常见的情况：
1. 未使用机票：如果您的机票尚未使用（即您还没有登机），通常可以全额或部分退还改签手续费。具体金额取决于航空公司的政策。
2. 已使用机票：如果您已经登机或使用了机票，那么改签手续费通常不会退还。在这种情况下，您需要支付新的改签手续费以更改航班日期或目的地。
3. 低折扣机票：对于低折扣或特价机票，航空公司通常会规定不能改签或改签手续费较高。这种情况下，即使您想改签，也可能无法退款或只能退很小的部分。
4. 提前改签：一般来说，提前时间越长，改签手续费越低。有些航空公司会提供免费的改签服务，但这也取决于具体的航班和购票渠道。
5. 在线预订平台：在一些在线预订平台上购买机票时，可能会提供不同的改签政策。因此，了解您购买的机票的具体改签政策是非常重要的。
总之，飞机改签手续费的扣除方式因航空公司、购票渠道和机票类型而异。建议您在购买机票时仔细阅读相关规定，并在需要改签时提前了解可能产生的费用。