车辆登记证书丢失的补办流程如下：
1. 首先，需要到当地的市级以上报纸刊登遗失声明。
2. 然后，携带以下材料去车管所办理补办手续：车主身份证原件及复印件、机动车所有人为个人的提供机动车所有人的身份证明（详见《机动车登记规定》第5条第1款），机动车所有人为单位的需提供《组织机构代码证书》复印件并加盖公章、委托代理人办理，需提供委托书和代理人身份证明及复印件。
3. 缴纳一定的工本费，这个费用因地区而异，一般在100-200元之间。
注意：以上步骤可能因当地政策或具体细节略有差异，建议提前咨询当地的车管所或者相关部门以获取最准确的信息。