营运车辆的行驶证丢失，需要按照以下步骤进行补办：
1. 准备相关材料：车主身份证（原件和复印件）、车辆登记证书（原件和复印件）、交强险保单（原件和复印件）。如果车主不是本人，还需要提供代办人的身份证及复印件和车主签字的委托书。
2. 填写《机动车牌证申请表》：到车管所或网上下载并填写《机动车牌证申请表》，详细填写车辆信息和个人信息。
3. 提交申请：将上述材料带到车管所服务窗口提交申请，工作人员会核实相关信息并办理手续。
4. 缴纳费用：根据当地政策，可能需要支付一定的工本费。
5. 领取新的行驶证：在规定的时间内，凭缴费凭证和受理凭证到车管所领取新的行驶证。
注意：不同地区的具体流程和所需材料可能略有差异，建议提前咨询当地车管所以确保顺利办理。