手动挡汽车在行驶过程中，不能长时间空挡滑行的原因主要有以下几点：
1. 安全性问题：空挡滑行时，发动机不再对驱动轮提供动力，车辆完全依靠惯性行驶。在这种情况下，如果遇到突发情况需要紧急制动，由于没有了发动机制动，车辆可能会失去控制，增加事故的风险。
2. 燃油经济性：虽然空挡滑行可以节省燃油，但现代汽车普遍采用电喷发动机，其喷油量是由发动机的转速和负荷决定的。当车辆在空挡滑行时，发动机的转速会下降，而喷油量并不会随之减少，反而可能导致燃油消耗的增加。
3. 对传动系统的影响：空挡滑行时，发动机与驱动轮的连接断开，导致发动机的反作用力无法传递到驱动轮上，而是直接作用在变速器上。长时间的空挡滑行可能对变速器的齿轮造成磨损，影响其使用寿命。
4. 对排放的影响：空挡滑行时，发动机的转速会降低，可能导致尾气排放不达标，对环境造成污染。
综上所述，手动挡汽车在行驶过程中，不宜长时间空挡滑行。在需要减速的情况下，应尽量使用发动机制动，或者适时挂入低速挡，以保证行车安全、提高燃油经济性和保护传动系统。