如果长按锁车键不能关闭车窗，可能的原因有以下几点：
1. 车辆设置问题。检查一下车辆的设置，确保车窗自动关闭功能已启用。
2. 钥匙电池电量不足。如果钥匙电池电量低，可能会影响遥控器的功能。更换新的电池试试。
3. 车窗传感器故障。车窗传感器可能损坏或故障，导致系统无法检测到车窗已经关闭。需要检查并修复或更换车窗传感器。
4. 车窗马达故障。车窗马达可能损坏或故障，导致车窗无法关闭。需要检查并修复或更换车窗马达。
5. 软件问题。车辆的控制模块可能存在软件问题，导致无法正常执行车窗关闭指令。需要进行软件升级或诊断维修。
建议尽快联系专业的汽车维修技师进行检查和维修，以确保行车安全。