1. 定义不同：
协议过户是指买卖双方在达成购房意向后，签订正式的购房合同。然后双方按照合同约定的内容进行房产交易，包括交付房款、交割房产证等手续。而直接过户则是买方直接将房产从卖方名下转移到自己名下的过程，不需要经过中介或第三方机构。
2. 流程不同：
协议过户需要经过以下几个步骤：协商一致→签订合同→支付房款→办理房产证交接→办理房产过户登记。而直接过户则只需要两个步骤：支付房款→办理房产过户登记。
3. 风险不同：
协议过户的风险相对较小，因为双方在签订合同之前已经进行了充分的沟通和协商，对房屋的权属、价格等问题都有了明确的了解。而直接过户的风险相对较大，因为没有第三方的监督和保障，容易出现纠纷和问题。