十三陵水库位于北京市昌平区，昌平区的天寿山麓，是1953年修建的一座水库，主要用于防洪、灌溉和工业用水。水库的建设过程中，确实涉及到一些古代墓葬的迁移和保护工作，但并没有完全淹没所有的十三陵皇陵。
十三陵是明朝皇帝的陵墓群，共有13位皇帝、23位皇后、2位太监和1位公主的陵墓。其中，长陵（成祖朱棣）、定陵（神宗朱翊钧）、永陵（世宗朱厚熜）、昭陵（穆宗朱载坖）和泰陵（孝宗朱祐樘）等五座皇帝陵墓位于水库建设区外，因此没有受到水库的影响。而其他八座皇帝陵墓以及部分后妃、太监和公主的陵墓则位于水库库区内，这些陵墓在建设水库时进行了迁移或保护措施。
总的来说，十三陵水库并没有完全淹没所有的十三陵皇陵，而是对其中的部分陵墓采取了迁移或保护措施。