1. 抖动问题：由于三缸发动机的物理特性，其运行过程中的平衡性相对较差，因此会产生较大的震动。虽然很多厂家都通过技术优化来减少这种抖动，但仍然无法完全消除。
2. 噪音问题：由于振动较大，三缸发动机在行驶过程中可能会产生更大的噪音。
3. 油耗表现：理论上讲，因为三缸发动机的气缸数量较少，应该能降低油耗。但实际上，由于振动等问题导致燃烧效率降低，反而可能导致油耗增加。
4. 维修成本：由于结构较为复杂，三缸发动机的维修成本可能高于四缸或更多气缸的发动机。
5. 保值率：由于上述原因，购买三缸发动机汽车的消费者可能会更少，因此在二手车市场上，这类车辆的保值率可能会较低。