车辆年检标志不同颜色的原因如下：
1、主要是为了方便交警检查，不用靠近就能大概判断出这辆车有没有在规定的日期年检；
2、年检是车辆安全性能认证，车标是认证的直接证明，有经验的交警只需扫一眼就可以清楚地看到是否通过年检，如果年检的颜色是一样的，检查可能就要停车进行；
3、年检标志主要是在实施高排放车交通管制措施的情况下，作为车辆在限行区域通行的凭证。