C1驾驶证在一个记分周期内被扣满12分的，需要按照以下步骤进行处理：
1. 学习理论知识：参加为期七天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
2. 考试：在学习结束后，需要进行相关知识的考试。如果考试不通过，还需要再次学习。
3. 领取处罚决定书：通过考试后，车管所会给你开具《行政处罚决定书》和《满分教育通知书》。
4. 参加道路驾驶技能（科目三）考试：在拿到处罚决定书后，需要在15日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门，参加道路驾驶技能（科目三）考试。如果考试不通过，可以再次预约考试。
5. 领取新的驾驶证：通过道路驾驶技能考试后，车管所会在你的驾驶证上扣除已处理的分数，并在一个工作日内发还给你。
注意：以上流程可能需要根据当地的具体规定有所不同，建议咨询当地的交通管理部门以获取最准确的信息。