车贷晚存了两天，可能的原因有以下几点：
1. 银行或金融机构的系统问题。有时候银行的系统升级或者出现故障，可能导致扣款失败。
2. 你的银行卡问题。可能是你的银行卡余额不足，或者是银行卡状态异常（如挂失、冻结等）导致无法成功扣款。
3. 贷款合同中的约定。有些贷款合同中会规定一定的宽限期，在宽限期内还款不会被视为逾期。如果你的还款日期正好在这个宽限期内，那么你的还款行为是正常的，不会被视为逾期。
4. 贷款机构的工作时间。如果你是在非工作日进行转账，可能会因为贷款机构的系统关闭而无法成功扣款。
建议你尽快联系贷款机构，了解具体原因并处理相关问题。如果确实已经逾期，及时还款并向贷款机构说明情况，避免影响个人信用记录。