如果汽车的登记证书（绿本）丢失，需要按照以下步骤进行补办：
1. 首先，你需要在当地的报纸上发布遗失声明。这通常需要花费几十元，用以证明你的绿本确实丢失了。
2. 然后，带着你的身份证和复印件、车辆的购车发票和复印件、车辆的行驶证到车管所申请遗失补办手续。
3. 填写《机动车登记证书补发申请表》并递交相关材料。
4. 等待车管所审核，审核通过后会给你一张领取新绿本的凭证。
5. 拿着这张凭证去指定的地点领取新的绿本。
如果你的绿本后来找到了，那么不需要做任何操作，因为一个车辆只能有一个有效的绿本。不过，为了避免将来再次丢失，建议你妥善保管好这个重要的证件。