蝙蝠飞过的房间是否有毒取决于多种因素，包括蝙蝠的种类、它们是否携带病原体以及房间内的环境。
1. 蝙蝠种类：不同种类的蝙蝠可能携带不同的病原体。例如，果蝠（Pteropus）和家蝠（Desmodus）可能会携带病毒，如埃博拉病毒、马尔堡病毒和狂犬病病毒等。而大多数其他种类的蝙蝠通常不携带对人类有害的病毒或细菌。
2. 病原体传播：即使蝙蝠携带病原体，这些病原体并不总是能够传播给人类。例如，狂犬病病毒可以通过蝙蝠唾液直接传播给人类，但其他病原体通常需要中间宿主才能传播给人类。
3. 房间环境：如果房间内有食物残渣、垃圾或其他适合蝙蝠停留的环境，那么蝙蝠可能会在房间内停留并释放病原体。在这种情况下，房间可能存在感染风险。
总之，蝙蝠飞过的房间不一定有毒，但这取决于蝙蝠的种类、它们是否携带病原体以及房间内的环境。为了避免潜在的风险，应保持房间清洁，避免与蝙蝠接触，并在发现蝙蝠时尽快请专业人士处理。