蒸发箱清洗不会影响空调的制冷效果。但是，如果清洗不当，可能会对空调系统产生不良影响。
蒸发箱是汽车空调系统中非常重要的一个部件，它负责将冷却液吸收的热量通过风扇吹出车外，从而降低车内温度。如果蒸发箱积满灰尘和污垢，会严重影响空调的制冷效果。因此，定期进行蒸发箱清洗是非常必要的。
然而，如果清洗过程中操作不当，例如使用不当的清洗剂或清洗方法不正确，可能会导致以下问题：
1. 损坏蒸发箱内部的电子元件，如传感器、控制阀等； 2. 导致制冷剂泄漏，影响空调制冷效果； 3. 清洗剂残留，可能对车内空气质量造成影响。
所以，在进行蒸发箱清洗时，建议找专业的汽车维修店进行，并确保使用的清洗剂和质量可靠的工具。这样既能保证清洗效果，又能避免对空调系统造成损害。