是的，电动摩托车也需要磨合期。在磨合期内，应遵循以下注意事项：
1. 避免高速行驶：新车在初次行驶1000公里内，应避免长时间高速行驶，以不超过3000转/分钟的速度行驶为宜。
2. 不要超载：新车在初次行驶1000公里内，应避免超载，一般不要超过车辆额定载重量的75%。
3. 注意轮胎气压：保持轮胎标准气压，避免过高或过低增加磨损。
4. 定期更换机油和滤芯：根据厂家推荐的时间间隔进行保养，更换机油和机油滤芯。
5. 注意电池液位：定期检查电池液位，确保液位在正常范围内。
6. 避免急加速、急刹车：尽量避免急加速、急刹车，以减少对零部件的冲击。
7. 清洁车辆：保持车辆的清洁，避免泥沙、尘土对车辆的腐蚀。
8. 遵守交通规则：遵守交通规则，避免发生交通事故。