电动车的合格证丢失了，可以采取以下措施：
1. 联系销售商或制造商：询问他们是否有备份的合格证或者是否可以重新办理一份。有时候，销售商会保留一些车辆的证书副本以备不时之需。
2. 咨询当地政府部门：不同地区的处理方式可能有所不同，最好先电话咨询当地的交通管理部门或车管所，了解补办手续和所需材料。
3. 准备相关材料：如果必须补办的话，你需要提供购车发票、身份证明等相关材料。这些资料可以帮助证明车辆的真实性和所有权。
4. 补办合格证：根据政府部门的指引，提交申请并支付相应的费用（如果有的话），等待新的合格证下发。这个过程可能需要一段时间，所以请耐心等候。
5. 注意：如果没有合格证，可能会影响上牌、过户等手续。因此，请尽快采取措施解决此问题。