根据公安部的《机动车登记规定》，机动车所有人申请变更车身颜色时，需要向登记地车辆管理所提交以下材料：
1. 《机动车变更登记申请表》； 2. 机动车所有人的身份证明原件及复印件； 3. 机动车登记证书； 4. 机动车行驶证； 5. 如需更换发动机或车身/车架的，还需提供新的发动机号和车辆识别代号拓印膜； 6. 如属于因质量问题更换整车的，需提供质量部门的证明； 7. 如机动车登记的使用性质发生改变，需提供相应的证明文件； 8. 如机动车所有人的住所迁出、迁入车辆管理所管辖区域的，需提供新的住所地址证明。
准备好以上材料后，机动车所有人应在变更后十日内向车辆管理所申请变更登记。