如果汽车的水箱温度过高，仍然继续行驶，可能会导致以下后果：
1. 发动机过热：当水温过高时，发动机的散热系统无法正常工作，导致发动机温度持续升高。这可能会损坏发动机内部零件，如活塞、气门和轴承等，进而影响发动机的性能和寿命。
2. 油压降低：水温过高会导致机油变稀，从而降低油压，使发动机难以正常运行。长时间的高温还可能使机油变质，进一步影响发动机的润滑效果。
3. 冷却系统故障：长期的水温过高可能导致冷却系统的零件老化、破裂或腐蚀，从而引发更严重的冷却系统故障。
4. 气囊故障：水温过高可能导致车辆的气囊系统出现故障，从而影响行车安全。
因此，当发现汽车水箱温度过高时，应立即停车并检查原因，避免对发动机造成进一步的损害。