1. 储存和运输困难：氢气是一种轻质气体，不易于压缩和储存。目前，氢气的储存方式主要有液化氢、压缩氢和金属氢化物等，但都存在一定的技术难题和挑战。
2. 生产成本较高：生产氢能源需要消耗大量的电能，而目前的发电方式主要是燃烧化石燃料，这使得氢能源的生产成本相对较高。
3. 安全性问题：氢气具有易燃易爆的特性，如果在储存、运输和使用过程中发生泄漏或碰撞，可能会引发火灾或爆炸事故。
4. 能源转换效率低：目前，许多氢能源的制备方法如电解水制氢等，其能量转换效率相对较低，这意味着产生同等数量的氢气需要消耗更多的能量。
5. 环境影响：虽然氢能源在燃烧时只产生水，但其制备过程可能产生一定的环境污染。例如，电解水制氢过程中会产生少量的臭氧和酸雨，而天然气重整制氢则会产生一定的二氧化碳排放。
6. 缺乏政策支持：虽然氢能源具有清洁、高效的优点，但目前许多国家和地区对其发展尚未给予足够的政策支持和优惠措施，这限制了氢能源的推广和应用。