是的，机动车登记证书丢了是可以补办的。根据《中华人民共和国道路交通安全法》和《机动车登记规定》的相关规定，如果机动车登记证书遗失，车主需要向车辆所在地的车管所申请补领。具体流程如下：
1. 车主向车管所提交《机动车登记证书补领、换领申请表》。
2. 车主提交身份证明原件及复印件。
3. 车主提交机动车行驶证。
4. 车主提交媒体公告声明的原件和复印件。
5. 车管所对提交的材料进行审核，符合条件的，受理补领申请。
6. 车主缴纳工本费，领取《临时行驶车号牌》。
7. 车主等待车管所通知，领取新的《机动车登记证书》。
请注意，不同地区的具体操作可能略有差异，建议提前咨询当地车管所了解详细流程。