机动车在6年后进行年检时，需要按照以下步骤操作：
1. 准备相关材料：车主需要携带驾驶证、身份证、行驶证、交强险保单等材料。如果车辆有违章记录，应先处理违章。
2. 预约年检时间：由于年检场地可能会很拥挤，建议提前在线预约年检时间，以避免排队等待。
3. 前往检测场：按照预约时间，驾车前往指定的机动车检测场。
4. 提交材料：向检测场工作人员提交驾驶证、身份证、行驶证等相关材料。
5. 车辆检测：将车辆开到检测线上，根据检测线的提示完成各项检测项目，如尾气排放检测、刹车性能检测等。
6. 领取检测报告：完成检测后，领取车辆的检测报告。
7. 缴纳检测费用：根据检测报告的结果，可能需要缴纳一定的检测费用。
8. 领取年检标志：完成缴费后，领取新的年检标志。
9. 更新行驶证：将新的年检标志粘贴在行驶证上，以证明车辆已按时参加年检。
通过以上步骤，您可以为您的机动车完成6年后的年检。