1. 工作原理不同：
水冷摩托车的冷却系统通过循环流动的水来吸收发动机产生的热量，然后将热量散发到空气中。而风冷摩托车的冷却系统则是利用空气的自然对流来散热。
2. 冷却效果不同：
水冷摩托车的冷却效果好于风冷摩托车。因为水的比热容大，能更有效地吸收和散发热量。所以，水冷摩托车在高温环境下性能更好，而且可以长时间高负荷运行。而风冷摩托车的冷却效果相对较差，尤其是在高温环境下，可能无法满足高性能摩托车的需求。
3. 重量和维护成本不同：
水冷摩托车的冷却系统通常较重，因为它需要携带一定量的冷却水。而风冷摩托车的冷却系统相对较轻。此外，水冷摩托车的维护成本通常高于风冷摩托车，因为需要定期更换冷却水、清洗水箱等。而风冷摩托车的维护相对简单，只需要检查风扇和散热片即可。
4. 噪音不同：
风冷摩托车的冷却系统通常会产生一定的噪音，而水冷摩托车的冷却系统则相对安静。
5. 环保性不同：
水冷摩托车的冷却系统需要使用水，而水是一种有限的资源。如果冷却水泄漏到环境中，可能会对环境造成污染。而风冷摩托车的冷却系统则不会产生这种问题。