如果你的摩托车合格证丢失了，你可以采取以下步骤来解决问题：
1. 联系销售商或制造商：首先，你应该联系购买摩托车的商家或者制造商。他们可能有你购车时提交的相关文件的副本，包括合格证。如果他们有备份，那么事情就简单多了，你可以请求一份新的复印件并附上他们的官方印章。
2. 申请补办：如果销售商或制造商无法提供合格证副本，你可能需要向当地的机动车管理部门申请补办。这个过程可能需要一些时间，因为相关部门需要进行审查和核实。你需要提供购车时的相关证明文件，如购车发票、交强险保单等。
3. 咨询律师：在某些情况下，你可能需要寻求专业法律建议。如果你的摩托车被扣押或禁止上路，你可能需要请一位律师来帮助解决这些问题。
4. 了解法规政策：不同地区对于合格证补办的政策可能会有所不同。因此，在采取行动之前，最好先了解一下你所在地区的具体规定。
总的来说，处理摩托车合格证丢失的问题需要耐心和时间。保持与销售商、制造商以及当地机动车管理部门的良好沟通将有助于解决这个问题。