在惠州市申请网约车驾驶员资格证需要遵循以下步骤：
1. 准备相关材料：身份证、驾驶证、行驶证（非本市户籍人员还需提供居住证）。
2. 参加线上培训：登录惠州市交通运输局官方网站，进行网约车驾驶员从业资格线上培训课程的学习，并参加考试。
3. 考试合格：完成线上培训并通过考试后，获得《网约车驾驶员培训结业证》。
4. 提交申请：携带上述准备好的材料以及《网约车驾驶员培训结业证》，到惠州市交通运输局政务服务窗口递交申请。
5. 背景审查：市交通运输局对申请人进行背景审查，包括违法犯罪记录、交通违法记录等。
6. 发放证件：背景审查合格后，市交通运输局向申请人发放《网络预约出租汽车驾驶员证》。
注意：以上流程可能会根据实际情况有所调整，建议提前咨询当地交通运输局以获取最准确的信息。