对于已经上牌的超重轻卡，如何处理违章，建议按照以下步骤进行：
1. 确认违章信息：首先需要了解具体的违章情况，包括违章时间、地点、行为等。可以通过交通网站查询或者手机APP进行查询。
2. 接受处罚：如果确认有违章行为，需要按照规定接受相应的处罚。处罚方式可能包括罚款、扣分、吊销驾照等。
3. 缴纳罚款：根据处罚结果，在规定的时间内缴纳罚款。罚款可以通过线上支付或者线下银行转账等方式进行。
4. 扣分处理：如果有扣分的情况，需要在规定时间内到车管所或者交警队进行处理。
5. 学习培训：如果需要参加学习培训的，要按照规定的时间和地点参加培训。
6. 恢复驾照：完成以上步骤后，可以恢复驾照正常使用。
需要注意的是，不同地区的具体处理方式可能会有所不同，建议咨询当地交通管理部门获取更准确的信息。