1. 工作原理不同：自然吸气发动机是利用大气压将空气吸入，然后通过进气门、活塞和燃烧室进入发动机内部；而涡轮增压发动机则是通过涡轮增压器将空气压缩后强制送入发动机。
2. 动力输出不同：自然吸气发动机的动力输出较为线性，随着油门深度的增加，动力输出会逐渐提高；而涡轮增压发动机在低转速时动力输出相对较弱，但在达到一定转速后，动力会迅速提升，具有明显的“涡轮迟滞”现象。
3. 燃油经济性不同：自然吸气发动机由于没有涡轮增压器，所以燃油消耗相对较低；而涡轮增压发动机由于增加了压缩空气的环节，所以在燃油消耗上会略高一些。
4. 噪音不同：自然吸气发动机由于没有涡轮增压器，所以运行时的噪音相对较小；而涡轮增压发动机由于增加了涡轮增压器，所以在运行时会产生一定的噪音。
5. 维护成本不同：自然吸气发动机的维护成本相对较低，因为其结构相对简单；而涡轮增压发动机由于其复杂的结构，所以在维护成本上会相对较高。