汽车空调系统有时制冷，有时不制冷的原因可能有以下几点：
1. 空调制冷剂不足或过多。制冷剂的多少直接影响到空调的制冷效果。如果制冷剂不足，空调的制冷效果会大打折扣；而如果制冷剂过多，则可能导致制冷效果不佳甚至完全不制冷。
2. 空调滤芯堵塞。空调滤芯的主要作用是过滤进入车内的空气，防止灰尘和杂质进入车内。如果空调滤芯堵塞，可能会导致进入车内的空气量减少，从而影响空调的制冷效果。
3. 空调系统有泄漏。空调系统的各个部件之间可能存在泄漏，导致制冷剂流失。这种情况下，即使制冷剂充足，空调的制冷效果也会受到影响。
4. 空调控制系统故障。空调控制系统的传感器、开关等部件出现故障时，可能导致空调无法正常工作。例如，温度传感器故障可能导致空调无法根据设定温度进行自动调节。
5. 空调系统其他部件故障。如压缩机、膨胀阀、蒸发器等部件出现故障，都可能导致空调制冷效果不佳。
建议将车辆送到专业的维修店进行检查和维修，以确保空调系统正常工作。