发生交通事故后，肇事者逃逸的，保险公司是否赔偿需要分情况讨论。
1. 如果交通事故发生后，肇事者及时报警并通知保险公司，那么保险公司会根据保险合同进行相应的赔偿。
2. 如果交通事故发生后，肇事者逃逸，那么根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条：“有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；（三）被保险人故意制造道路交通事故的。有前款所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。” 因此，如果肇事者在事故发生后逃逸，保险公司可以不予赔偿。但是，如果事故导致人身伤亡，保险公司仍会承担无责任的赔偿。