发动机自动启停系统故障的解决方法如下：
1. 检查故障代码：首先，需要使用专业的诊断工具读取车辆的故障代码，以确定具体哪个部件出现问题。这有助于缩小问题范围并找到解决方案。
2. 清洁传感器和连接器：自动启停系统的传感器和连接器可能会受到灰尘、污垢或其他物质的污染，导致信号传输不畅。清洁这些部件可以恢复系统的正常工作。
3. 更换电池：自动启停系统通常需要一个良好的电池来支持其功能。如果电池老化或电量不足，可能导致系统无法正常工作。更换电池可能解决问题。
4. 检查线路：自动启停系统的线路可能会出现松动、磨损或短路等问题。检查并修复这些问题可以恢复正常工作。
5. 更新软件：有时，自动启停系统的软件故障也可能导致系统无法正常工作。在这种情况下，可能需要联系制造商进行软件更新。
6. 维修或更换部件：如果以上方法都无法解决问题，可能需要进一步检查自动启停系统的其他部件，如发动机控制模块、传感器等。如果发现损坏的部件，需要进行维修或更换。
总之，解决发动机自动启停系统故障需要根据具体的故障情况进行分析和处理。在排除故障之前，建议寻求专业技师的帮助。