要消除发动机自动启停系统的故障，首先需要确定故障的具体原因。这可能包括传感器故障、控制系统故障或其他电气问题。以下是一些建议的步骤来解决问题：
1. 检查自动启停系统的所有传感器和连接器，确保它们没有损坏、松动或腐蚀。如果发现任何问题，请修复并进行清洁。
2. 使用诊断工具检查自动启停系统的控制模块是否存在故障代码。如果有故障代码，根据提示进行修复。这可能包括更新软件、更换零件或重新编程。
3. 如果诊断工具显示控制模块正常工作，但自动启停系统仍然无法正常工作，可能需要检查与其他系统交互的线路和控制模块。例如，检查与刹车系统的连接是否正常，以确保刹车开关在正确的时间发送信号。
4. 如果以上步骤都无法解决问题，可能需要将车辆送到专业维修店进行检查和维修。在那里，技术人员可以使用更先进的设备和技术来诊断和修复自动启停系统的故障。
请注意，如果您不确定如何进行这些步骤，建议您寻求专业人士的帮助。在进行任何维修之前，确保了解车辆的电路图和安全操作规程。