在北京，驾驶员的B类驾照如果有扣分，需要按照以下步骤进行处理：
1. 学习：如果扣分达到或超过12分，驾驶员需要参加为期七天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
2. 考试：在学习结束后，驾驶员需要进行科目一（理论）考试。如果考试不通过，还需要再次学习并考试。
3. 缴纳罚款：驾驶员需要根据交通违章行为和处罚决定书缴纳相应的罚款。
4. 办理清分手续：在缴纳罚款后，驾驶员可以携带相关材料到车管所或者网上办理驾驶证清分手续。
5. 注意事项：对于累计积分达到12分的B类驾照，如果在一个记分周期内没有达到学习的标准，记分将被带入下一个记分周期。
以上是一般情况下的处理流程，具体情况可能因个人情况和当地政策有所不同，建议咨询相关部门以获取最准确的信息。