在北京，对于违反限行规定的车辆，交通管理部门会对其进行处罚。具体的处罚措施如下：
1. 对于违反限行规定的车辆，交通管理部门会将车辆的违法行为记录在案，并在该车的交通安全信用记录中扣分。
2. 车主需要在收到罚单后的规定时间内缴纳罚款，否则将会产生滞纳金。罚款金额根据车型和违反限行的次数有所不同，一般来说，罚款金额为200元。
3. 如果车辆在一年内违反限行规定达三次或以上的，除了罚款外，车辆的保险费率将会上调。
4. 对于企业车辆，违反限行规定的，除了对车辆进行处罚外，还会对企业进行处罚，例如暂停或撤销企业的交通营运资质等。