如果你的两轮电动车的合格证丢失了，你可以采取以下措施：
1. 联系销售商或制造商。他们可能有你购买车辆的原始记录和证书副本。询问是否可以重新发放一份新的合格证或者提供复印件。
2. 如果无法从销售商或制造商那里获得帮助，你可能需要联系当地的交通管理部门。他们可能有你的车辆信息并且可以为你提供一份证明文件以替代丢失的合格证。
3. 在大多数情况下，你仍然可以在没有合格证的情况下使用你的电动车。但是，你可能需要在当地交通管理部门办理一些手续以确保你的车辆合法上路。
4. 如果你打算将车辆转让给他人，你需要确保新的车主能够合法地拥有和使用该车辆。这可能包括让他们去联系销售商、制造商或当地交通管理部门来处理合格证的缺失问题。