是的，上海对外地绿牌车（新能源汽车）进行限行。根据上海市发布的《上海市通告》规定，外地绿牌车在高峰时段禁止在上路行驶。具体限行措施如下：
1. 每日7时至10时、15时至20时，禁止悬挂外省市机动车号牌的小客车在上海市内环线(不包括)以内路面通行。
2. 周六、周日和法定节假日的9时至17时，也禁止悬挂外省市机动车号牌的小客车在上海市内环线(不包括)以内路面通行。
3. 此外，对于未按照规定的时间、路线行驶的，或者未按照规定的方式使用区域指标、尚未办理手续就擅自上路的外地绿牌车，将会受到相应的处罚。