C1驾驶证扣12分的处理流程如下：
1. 学习理论知识：首先，你需要参加为期一星期的交通法规知识培训。这个培训是免费的，由交通部门组织。
2. 参加考试：培训结束后，你需要通过相关的考试，考试内容主要是你所学到的交通安全法规和驾驶知识。如果考试不通过，你需要重新参加培训。
3. 领取处罚决定书：如果你通过了考试，你将收到一份处罚决定书。你需要在15天内缴纳罚款。
4. 参加科目一考试：如果你在15天内没有缴纳罚款，你的驾照将被吊销。你需要重新报名参加驾驶证考试，包括科目一（交通法规）和科目二（场地驾驶技能）。
5. 恢复驾驶资格：当你完成以上所有步骤后，你可以重新获得驾驶资格。但需要注意的是，你在接下来的两年内不能再违反交规，否则你的驾照将被吊销。