C1驾驶证一次性被扣12分的，需要按照以下步骤进行处理：
1. 学习相关法规：首先，你需要参加为期一日的交通安全法律法规知识学习，这个学习是免费的。
2. 领取科目一考试通知书：学习结束后，车管所会给你一份科目一（理论考试）的考试通知书。
3. 预约并参加考试：在通知的规定时间内，通过驾校或者车管所的网站进行预约科目一考试。考试通过后，你将获得满分考试的合格证明。
4. 领取驾驶证或重新学习：携带满分考试的合格证明和身份证，到车管所办理清分业务，领取新的驾驶证。如果你的驾驶证被扣满12分后，一年内未能通过科目一考试，那么你的驾驶证将被吊销，你需要重新报名学习并考取驾驶证。