B2驾驶证扣12分的处理方法如下：
1. 学习理论知识：驾驶员需要在扣分后15天内参加由当地车管所组织的科目一（道路交通安全法律、法规和相关知识）的学习。
2. 参加考试：在通过科目一的学习后，驾驶员还需要在20日内安排并参加相关科目的考试。考试科目包括科目二和科目三。
3. 领取新驾照：如果考试合格，驾驶员将重新获得驾驶执照；如果不合格，驾驶员的B2驾驶证将被注销。
4. 重新申请：如果B2驾驶证被注销，驾驶员需要重新报名参加B2驾驶证的考试并取得合格成绩后才能再次获得B2驾驶证。
注意：在处理过程中，驾驶员应保持合法驾驶状态，避免再次发生扣分行为。