这可能是由于以下原因：
1. 计费错误：有时候，高速公路的收费系统可能会出现故障或计算错误，导致即使是在免费通行期间，您的ETC仍然被扣费。这种情况下，您可以向相关管理部门申诉并申请退款。
2. 免费通行政策不适用于所有车辆：有些免费通行政策可能只适用于特定车型或者特定时间段的车辆。如果您不符合这些条件，那么您的ETC可能会被扣费。
3. 未正确安装或使用ETC设备：如果您的ETC设备没有正确安装或使用，可能会导致无法正常识别您的车辆信息，从而被扣费。请确保您的ETC设备已经正确安装并正常使用。
4. 混合交通情况：在一些高速公路上，可能会同时存在人工收费和ETC收费的车道。当您从混合收费通道通过时，即使是在免费通行期间，也可能被误认为是需要缴费的车辆而被扣费。
总之，如果遇到这种情况，建议您首先了解当地的免费通行政策，确认自己的车辆是否符合免费条件。然后检查您的ETC设备是否正常安装和使用，并向相关部门咨询和申诉。