根据《上海市非营业性客车额度拍卖管理规定》，对于违反“开四停四”规定的车辆，上海交通管理部门将采取以下措施：
1. 罚款：首次违反规定的，处以200元罚款；第二次违反规定的，处以500元罚款；第三次及以上违反规定的，处以1000元罚款。
2. 记分：违反“开四停四”规定的行为将记3分。
3. 暂停办理拍卖申请：对于一年内累计三次以上（含三次）违反“开四停四”规定的车主，暂停其参加拍卖申请资格六个月。
4. 暂停更新指标申请：对于一年内累计三次以上（含三次）违反“开四停四”规定的车主，暂停其办理更新指标申请资格六个月。