当您的车辆因涉水行驶或被水淹导致发动机损坏时，您可以按照以下步骤向保险公司申请赔偿：
1. 立即报警：在发现车辆被淹后，您应立即拨打交警报警电话，说明情况并获取出警记录。这将有助于您在后续理赔过程中提供证据。
2. 拍照留证：拍摄车辆被淹的照片和视频，记录车辆的位置、周围环境和水位高度等信息。确保照片清晰可辨，以便在理赔过程中作为证据。
3. 联系保险公司：尽快联系您的保险公司，报告车辆被淹的情况。了解保险公司对于此类事故的理赔流程和要求。
4. 配合现场勘查：根据保险公司的要求，您可能需要前往现场协助进行勘查。在此过程中，确保如实提供相关信息，以便保险公司评估损失。
5. 提交理赔材料：根据保险公司的要求，您需要提交相关理赔材料，如出警记录、照片、视频等。确保提交的材料完整、真实，以提高理赔成功率。
6. 等待赔付：保险公司会根据您提交的材料和现场勘查结果，进行评估并决定是否赔付。在获得赔付前，请保持与保险公司的沟通，了解赔付进度。
请注意，具体的理赔流程和所需材料可能因保险公司而异。建议您在购买保险时详细了解保险公司的理赔政策和要求，以便在发生事故时能够顺利处理。