对于货车超载50%以上100%以下的，运政部门会根据《道路运输条例》以及《道路交通管理条例》等相关法律法规进行处罚。具体的处罚措施可能包括：
1. 罚款：根据货车的超载程度和具体情况，处以一定数额的罚款。罚款金额通常为车辆额定载质量的每千克一定金额，最低罚款金额不低于一千元。
2. 扣分：对货车司机的驾驶证进行扣分处理。具体扣分数额可能会因地区和具体情况而有所不同。
3. 吊销营运证：如果货车属于营运车辆，且超载行为严重影响了道路安全，运政部门有权吊销其营运证。
4. 责令整改：运政部门会要求货车运输单位或个人采取措施消除违法行为，例如将超载货物进行合理转运等。
5. 禁止参加交通招投标：对于多次违法超载的货运企业，运政部门可以禁止其参加交通招投标活动。