纳智捷S5二手车价格相对较低的原因可能有以下几点：
1. 品牌认可度低：纳智捷是台湾裕隆汽车与大陆合资的品牌，虽然其产品力在同级车型中表现尚可，但由于进入市场较晚，品牌知名度和口碑积累不足，导致消费者对其认可度不高。
2. 保值率较低：由于品牌认可度的关系，纳智捷S5的二手车保值率相对较低，因此即使车辆使用年限较短，但二手价格仍然会受到一定影响。
3. 市场竞争激烈：随着中国汽车市场的快速发展，竞争日益激烈，各大汽车品牌纷纷推出新款或升级款，使得一些较早上市的车型面临较大的市场压力，这也影响了纳智捷S5的二手车价格。
4. 维修保养成本较高：由于品牌认知度较低，纳智捷S5的维修保养成本可能会相对较高，这也会影响到购买二手车的消费者的决策。