在下雨天进行科目三的靠边停车操作时，需要注意以下几点：
1. 确保雨刷器处于合适的位置，以便看清前方道路。
2. 打开车灯，包括前照灯、尾灯和转向灯，以提高能见度并让自己被其他司机看到。
3. 降低车速，因为雨天路面湿滑，需要更大的安全车距。
4. 使用倒车雷达或后视镜观察后方交通情况，确保安全。
5. 由于视线受限，可以借助路边标线、路边石等参照物来判断车辆与路肩的距离。
6. 在靠近路肩时，注意观察右侧后视镜，确保车辆与路肩保持适当的距离。
7. 当车辆接近路肩时，轻踩刹车减速，然后稳住方向盘，将车辆平稳地驶入路肩。
8. 关闭所有车灯，熄火，拉起手刹，然后解安全带下车。
总之，在下雨天进行靠边停车操作时，要保持冷静，降低车速，注意安全，并充分利用后视镜和其他辅助设备来确保停车过程的安全顺利。