1937年，抗日战争爆发，为了保护中国的文化遗产，当时的国民政府决定把故宫博物院的珍贵文物进行南迁。这批文物包括皇家档案和故宫的国宝文物，共计13427箱。南迁的路线是先沿平汉铁路至汉口，然后转长江船运至重庆，最后到达南京。在这个过程中，文物先后在长沙、桂林、成都等地进行了展览，以普及历史文化知识，鼓舞民众抗敌斗志。
1945年抗日战争胜利后，这批文物于1947年返回南京，并在南京博物院进行了短暂的展示。1949年中华人民共和国成立后，这批文物被运往台北，现藏于台湾故宫博物院。因此，皇家档案和故宫国宝文物在抗日战争期间南迁，最终到达了台湾。