甲鱼头骨的处理方法如下：
1. 首先，将甲鱼清洗干净。去除内脏、甲壳和四肢。注意保留头骨部分。
2. 将甲鱼的肉和壳分开。用锋利的刀沿着甲鱼的壳边缘切割，将肉与壳分离。尽量保持头骨的完整。
3. 将分离出的甲鱼肉切成适当大小的块状，备用。
4. 将甲鱼壳清洗干净，放入大锅中，加入足够的水，大火煮沸后转小火煮1小时。期间要不断撇去浮沫。
5. 将煮好的甲鱼壳捞出，沥干水分。此时甲鱼壳已经变得较为洁白。
6. 将甲鱼肉和头骨放入锅中，继续煮30-60分钟，直到鱼肉熟透。期间要注意观察水量，适时加水。
7. 最后，将煮好的甲鱼肉和头骨捞出，沥干水分。此时甲鱼肉和头骨都已经变得较为洁白。
注意事项：
1. 在整个烹饪过程中，要保持火候的适中，避免甲鱼肉和头骨变黄或变黑。
2. 如果发现甲鱼肉或头骨有变黑或变黄的现象，可以尝试用食用碱水浸泡，然后冲洗干净，再按照上述步骤进行烹饪。